Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
RETNLBQ9BQ08 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms