Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms