Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms