Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms