Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms