Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms