Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms