Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKDCCQ504Y2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms