Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTC1Q2NKJ3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTC1Q2NKJ3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms