Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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