Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NRF1Q16656 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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