Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PDCD1Q15116 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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