Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms