Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEXNQ0ZGT2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms