Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms