Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CCL8P80075 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CCL8P80075 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CCL8P80075 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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