Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms