Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC089987.2-201ENST00000328207 936 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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