Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OTX2P32243 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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OTX2P32243 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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OTX2P32243 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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OTX2P32243 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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OTX2P32243 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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OTX2P32243 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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