Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms