Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms