Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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