Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms