Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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