Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A3BPQ9Y5P4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms