Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms