Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H9

PCDHA2, Protocadherin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA2Q9Y5H9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA2Q9Y5H9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHA2Q9Y5H9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA2Q9Y5H9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms