Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARP1Q9Y4F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FARP1Q9Y4F1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms