Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP1Q9Y3L3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1Q9Y3L3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms