Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAB39Q9Y376 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAB39Q9Y376 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms