Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX24Q9Y343 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX24Q9Y343 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX24Q9Y343 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms