Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIKFYVEQ9Y2I7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms