Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUDCQ9Y266 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
NUDCQ9Y266 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUDCQ9Y266 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms