Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP3Q9Y228 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF3IP3Q9Y228 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms