Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVW-1Q9UQF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVW-1Q9UQF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms