Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN6Q9UQ52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN6Q9UQ52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms