Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms