Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP1Q9UPQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms