Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA2G4CQ9UP65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA2G4CQ9UP65 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA2G4CQ9UP65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA2G4CQ9UP65 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA2G4CQ9UP65 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA2G4CQ9UP65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLA2G4CQ9UP65 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4CQ9UP65 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms