Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCML1Q9UN30 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML1Q9UN30 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms