Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT6Q9ULM6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms