Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF490Q9ULM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF490Q9ULM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms