Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PADI1Q9ULC6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms