Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms