Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MID2Q9UJV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms