Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBE1Q9UJT0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBE1Q9UJT0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms