Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS3Q9UJD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIMS3Q9UJD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms