Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO3A1Q9UIG8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms