Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP25Q9UHP3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms