Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP2Q9UHC6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP2Q9UHC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518.2 ms